当前食品安全存在的主要问题是：

一、地质特点、矿山冶炼、废物排放等造成的农产品被重金属污染。

二、垃圾焚烧、生产废水排放等造成的食品中存在一定水平的持久性有机污染物。

三、为按照国家农药使用规定在蔬菜、水果和粮食种植中过量施用或者施用禁用农药。

四、在畜、禽动物饲养过程中未按照国家规定的药物品种以及允许使用品种的合理休药期使用禽药。

五、由于种植环境、储存环境和自然灾害等造成农作物中存在的真菌毒素问题。

六、在包装材料生产中使用国家为批准的有毒生产助剂而导致迁移至食品的问题。

七、在食品生产加工中为按照食品添加剂使用卫生标准的规定，在食品中滥用或违规使用食品添加剂。

八、在养殖环节和生产环节存在使用非法添加物质的现象。

九、生产加工过程工艺不合理，生产场所卫生状况差，导致成品中存在微生物指标不合格的现象。

十、部分生食食品中存在致病菌、病毒和寄生虫。